Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELLP55199 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELLP55199 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELLP55199 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELLP55199 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELLP55199 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELLP55199 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ELLP55199 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ELLP55199 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms