Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HADHBP55084 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HADHBP55084 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HADHBP55084 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HADHBP55084 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HADHBP55084 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HADHBP55084 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HADHBP55084 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HADHBP55084 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HADHBP55084 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms