Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD23BP54727 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23BP54727 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms