Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA8P53708 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms