Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVDP53602 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MVDP53602 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVDP53602 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVDP53602 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MVDP53602 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MVDP53602 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVDP53602 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVDP53602 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVDP53602 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MVDP53602 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms