Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK4P51957 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK4P51957 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK4P51957 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK4P51957 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK4P51957 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK4P51957 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEK4P51957 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK4P51957 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK4P51957 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK4P51957 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK4P51957 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK4P51957 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK4P51957 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK4P51957 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK4P51957 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK4P51957 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEK4P51957 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NEK4P51957 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK4P51957 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK4P51957 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK4P51957 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK4P51957 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK4P51957 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms