Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR3P51677 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR3P51677 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR3P51677 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR3P51677 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR3P51677 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR3P51677 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR3P51677 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR3P51677 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR3P51677 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR3P51677 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR3P51677 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR3P51677 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR3P51677 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms