Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCA2P51587 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms