Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX5P50542 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX5P50542 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX5P50542 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX5P50542 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX5P50542 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX5P50542 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX5P50542 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX5P50542 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX5P50542 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX5P50542 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX5P50542 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX5P50542 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX5P50542 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX5P50542 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX5P50542 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX5P50542 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX5P50542 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX5P50542 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms