Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC2P49815 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC2P49815 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC2P49815 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC2P49815 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC2P49815 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC2P49815 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSC2P49815 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC2P49815 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC2P49815 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms