Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLK1P49759 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLK1P49759 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLK1P49759 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLK1P49759 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLK1P49759 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CLK1P49759 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLK1P49759 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLK1P49759 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLK1P49759 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLK1P49759 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms