Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP1P48552 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP1P48552 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms