Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RECQLP46063 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RECQLP46063 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RECQLP46063 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RECQLP46063 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RECQLP46063 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RECQLP46063 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RECQLP46063 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RECQLP46063 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RECQLP46063 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RECQLP46063 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RECQLP46063 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms