Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms