Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PIK3CBP42338 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms