Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK1P39086 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms