Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC1P36383 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC1P36383 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC1P36383 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC1P36383 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC1P36383 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC1P36383 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC1P36383 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC1P36383 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC1P36383 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms