Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX5P35711 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX5P35711 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX5P35711 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX5P35711 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX5P35711 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms