Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFC1P35251 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFC1P35251 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFC1P35251 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RFC1P35251 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC1P35251 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFC1P35251 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms