Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFTPDP35247 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFTPDP35247 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms