Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms