Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA13P31271 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms