Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CLIP1P30622 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms