Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID4AP29374 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms