Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms