Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
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PTPRMP28827 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
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PTPRMP28827 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRMP28827 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
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