Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB6P28072 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms