Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms