Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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