Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX3P23760 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX3P23760 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAX3P23760 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX3P23760 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX3P23760 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX3P23760 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX3P23760 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX3P23760 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX3P23760 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX3P23760 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX3P23760 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX3P23760 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms