Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRGP23470 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRGP23470 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
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