Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms