Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCP20941 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCP20941 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCP20941 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCP20941 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCP20941 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCP20941 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCP20941 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCP20941 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCP20941 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCP20941 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCP20941 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCP20941 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCP20941 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCP20941 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCP20941 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCP20941 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCP20941 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCP20941 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms