Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms