Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B1P20020 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms