Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATF3P18847 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATF3P18847 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATF3P18847 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATF3P18847 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATF3P18847 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATF3P18847 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ATF3P18847 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATF3P18847 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATF3P18847 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATF3P18847 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATF3P18847 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATF3P18847 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATF3P18847 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF3P18847 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATF3P18847 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATF3P18847 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATF3P18847 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATF3P18847 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATF3P18847 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF3P18847 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF3P18847 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATF3P18847 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATF3P18847 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATF3P18847 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATF3P18847 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATF3P18847 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
ATF3P18847 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF3P18847 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF3P18847 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF3P18847 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF3P18847 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms