Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3L1P16619 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms