Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPB42P16452 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPB42P16452 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPB42P16452 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPB42P16452 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPB42P16452 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPB42P16452 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPB42P16452 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPB42P16452 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms