Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCL5P13501 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCL5P13501 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL5P13501 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL5P13501 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL5P13501 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL5P13501 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL5P13501 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL5P13501 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL5P13501 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCL5P13501 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCL5P13501 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCL5P13501 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCL5P13501 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL5P13501 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL5P13501 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL5P13501 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL5P13501 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL5P13501 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL5P13501 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL5P13501 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL5P13501 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms