Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM1P11229 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms