Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB41P11171 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB41P11171 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPB41P11171 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB41P11171 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPB41P11171 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPB41P11171 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB41P11171 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB41P11171 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB41P11171 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms