Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MCF2P10911 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2P10911 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2P10911 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2P10911 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2P10911 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCF2P10911 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCF2P10911 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCF2P10911 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCF2P10911 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
MCF2P10911 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2P10911 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2P10911 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2P10911 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MCF2P10911 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCF2P10911 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCF2P10911 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms