Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPD1P10809 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPD1P10809 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms