Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRFP10586 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms