Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf88P0DMB2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C8orf88P0DMB2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms