Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms