Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM228BP0C875 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms