Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VIL1P09327 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VIL1P09327 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIL1P09327 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIL1P09327 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIL1P09327 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIL1P09327 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIL1P09327 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIL1P09327 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VIL1P09327 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VIL1P09327 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIL1P09327 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIL1P09327 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIL1P09327 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIL1P09327 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIL1P09327 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIL1P09327 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIL1P09327 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIL1P09327 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms