Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC4P09017 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC4P09017 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC4P09017 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms