Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM2P07951 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM2P07951 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM2P07951 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM2P07951 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM2P07951 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM2P07951 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPM2P07951 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPM2P07951 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM2P07951 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM2P07951 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM2P07951 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM2P07951 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM2P07951 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM2P07951 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM2P07951 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM2P07951 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM2P07951 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM2P07951 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM2P07951 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms